Nemo, un jeune poisson-clown curieux se retrouve accidentellement dans l'aquarium de la clinique d'un dentiste à Sydney en Australie. Inquiet, Marlin, son père et Dory, un poisson bleu amical mais distrait, partent à sa recherche. Durant leur périple, ils croiseront des requins végétariens, des tortues surfeuses, des méduses hypnotiques et des goélands affamés pendant que Nemo, de son côté, prépare un plan audacieux pour rentrer à la maison en toute sécurité.